晴朗时节，江户川柯南（高山南 配音）和毛利小五郎（小山力也 配音）、小兰（山崎和佳奈 配音）以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都，之后，飞船就被厚厚的舱盖包裹起来，外面的射线无法射进来一丝，但同时也阻挡了外面的宇雷风景。陈源和苏云像坐在了一间在飞速飞行的房子里面。他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感觉，期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员藤井七海（柴咲幸 配音）。谁知快乐的氛..